Научно истраживачке и услужне дјелатности у Заводу се спроводе кроз неколико организационих цијелина:

• Одјељење за земљиште
• Одјељење за агрохемију и исхрану биљака
• Одјељење за агроекологију
• Одјељење за ГИС